Em biologia molecular, STRING (Ferramenta de pesquisa para a recuperação de genes/proteínas interativos) é um banco de dados biológico e recurso da web de interações proteína-proteína conhecidas e previstas. … A última versão 11b contém informações sobre cerca de 24,5 milhões de proteínas de mais de 5.000 organismos.
Qual é a finalidade do banco de dados STRING?
A base de dados STRING visa coletar e integrar essas informações, consolidando dados de associação de proteínas conhecidas e previstas–para um grande número de organismos.
O que é uma pontuação STRING?
Em STRING, cada interação proteína-proteína é anotada com uma ou mais 'pontuações'. É importante ress altar que essas pontuações não indicam a força ou a especificidade da interação. Em vez disso, eles são indicadores de confiança, ou seja, a probabilidade de STRING julgar uma interação como verdadeira, dadas as evidências disponíveis.
Por que as proteínas interagem?
Interações proteína-proteína (PPIs) são contatos físicos de alta especificidade estabelecidos entre duas ou mais moléculas de proteína como resultado de eventos bioquímicos dirigidos por interações que incluem forças eletrostáticas, hidrogênio ligação e o efeito hidrofóbico.
O que é associação funcional?
definição. Relação binária entre entidades biológicas quando uma delas modula a outra em termos de função, expressão, degradação ou estabilidade da outra e da relaçãoentre os parceiros não pode ser determinado como direto, portanto, etapas intermediárias estão implicitamente presentes.